Тема 5. Построение и исследование имитационных моделей биохимических реакций.

Тема № 5. Построение и исследование имитационных моделей биохимических реакций План • Построение моделей простых биохимических реакций в Simbiology.. • Исследование динамики концентраций метаболитов при изменении параметров модели. • Построение моделей... More

Тема № 5. Построение и исследование имитационных моделей биохимических реакций План • Построение моделей простых биохимических реакций в Simbiology.. • Исследование динамики концентраций метаболитов при изменении параметров модели. • Построение моделей мультимолекулярных реакций в Simbilogy. Теория Алгоритм построения модели в SimBiology 1. Запустить SimBiology, с использованием команды simbiology. 2. Создать новую модель кнопкой New →Add model →Create new blank model и назвать ее. 3. Перейти в окно построения диаграммы через путь Open → Diagram. 4. Добавить необходимые вещества (метаболиты) и реакции путем перетаскивания из поля Block Library Browser метаболитов («species») и реакций («reactions») в компартмент («compartment») рабочей области. Назвать все вещества и реакции. 5. Настроить кинетику реакций. a. Дважды щелкуть на кружок, который соответствует необходимой реакции. Назвать реакцию (поле «Name»), используя латинские буквы. b. Выбрать кинетический закон. («Model Building: Rea Less